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Es incuestionable su origen árabe. Se trataba de un mashar hispanomulsumán o alquería (mashar de Abu Yahya). El establecimiento del núcleo pudo haber sido anterior a la llegada de los mahometanos, pues según consta en el archivo municipal, un crucifijo antiquísimo estuvo conservado 700 años durante la invasión musulmana en una cueva llamada de la Hiedra.
La fundación del pueblo data de 1572. La iglesia parroquial, sin embargo, fue edificada en 1505 y puesta bajo la advocación de San Jacinto, que más tarde será reconstruida con la financiación de la familia Gálvez. 
Durante el siglo XVII, Macharaviaya lleva una vida próspera basada en la economía del cultivo de la vid. Un siglo después la familia Gálvez (Matías, José, Miguel, Antonio y Bernardo) se lanza a la aventura americana. Bernardo de Gálvez fue nombrado marqués de la Sonora, virrey de las Indias. Esto supuso un importante empuje para la economía de la villa.
La huella de la familia Gálvez, cuya influencia dio origen a que a Macharaviaya se la conociera como el pequeño Madrid, se reflejó en la reconstrucción de la iglesia, el impulso a la agricultura y en la instalación de la Fábrica de Naipes, que poseía el monopolio de este producto para su venta en América. El edificio de la antigua fábrica está hoy habilitado para uso residencial.
Pese a ser importante lo citado anteriormente, la aportación de los Gálvez a la mejora del municipio fue decisiva: compraron el suelo del núcleo y los ruedos para posteriormente cedérse los al municipio, con lo que el Ayuntamiento posee hoy día una importante masa patrimonial de suelo.
Otro Gálvez, Matías, vizconde de Galveston, fue virrey de Nueva España y legó su nombre a Tejas. Le sucedió en el virreinato su hijo Bernardo, conde de Gálvez, que desempeñó un importante papel en la independencia de Estados Unidos. Por su parte, Miguel fue embajador en Prusia y en Rusia en tiempos de Catalina la Grande, introduciendo el vino malagueño en las cortes europeas. Y Antonio fundó el Departamento Marítimo de Cádiz.